Untuk mencapai visi yang telah disusun, perlu dirumuskan misi berupa kegiatan jangka panjang dengan arah yang jelas. Berikut ini merupakan misi yang dirumuskan berdasarkan visi tersebut:
- Menghadirkan pembiasaan sikap sehari-hari guru dan murid serta walimurid yang berakhlakul karimah berkarakteristik Aswaja An-Nahdliyyah sesuai nilai-nilai keluhuran budaya bangsa.
- Mengintegrasikan nilai-nilai Aswaja dalam berbagai aspek pembelajaran dan kegiatan madrasah.
- Mendorong dan membantu murid agar mampu mencapai hasil maksimal dalam program unggulan Madrasah (Tahfidz, mengaji, Pembiasaan akhlak dan etika belajar Santri, serta penguatan Aqidah Keagamaan Aswaja an-Nahdliyyah).
- Menyelenggarakan pendidikan berkualitas yang berbasis IT di semua mata pelajaran.
- Menyelenggarakan pembelajaran dengan berbagai inovasi, model, dan metode yang bervariasi.
- Menyelenggarakan pembelajaran dengan menumbuh kembangkan kemampuan berpikir kritis, kreatif,kolaboratif dan selalu berperan aktif dalam pemecahan masalah belajar peserta didik.
- Memberikan kesempatan yang seluas-luasnyan bagi murid untuk mengembangkan potensi akademik dan non akademik melalui berbagai kegiatan pembelajaran.
- Membina murid memiliki karakter yang kuat disiplin, tanggung jawab, mandiri, percaya diri dan kompetitif.
- Mencetak lulusan yang unggul, berakhlakul karimah dan ber berkarakter Aswaja An-Nahdliyyah yang mampu bersaing di pendidikan yang lebih tinggi serta mampu beradaptasi dengan perubahan zaman.